Na het opbouwen en het controleren van de basisfuncties en communicatie-opties kan het 537-basissysteem geprogrammeerd worden. Hierbij dient met een aantal bijzonderheden rekening te worden gehouden. Verder moet nog worden toegelicht hoe het board met uitbreidingen en extra componenten in de praktijk ingezet kan worden.Een belangrijke eigenschap van het board zijn de drie verschillende modes waarin het gebruikt kan worden: stand-alone-, program-download- en run-mode. Hoe de jumpers en de schakelaar voor deze modes geplaatst moeten worden, is te vinden in tabel 1.De stand-alone-mode is de mode waarin het systeem uiteindelijk gebruikt zal worden. Deze mode wordt ingezet als het programma helemaal getest is en foutloos in een bepaalde toepassing functioneert. Het programma wordt na een reset van het systeem vanuit de EPROM gestart.